Von der Basis Zürich aus werden hauptsächlich Flüge in den Mittelmeerraum, auf die Kanaren und zu touristischen Zielen in aller Welt (San Diego, Mauritius, Dominikanische Republik, Thailand usw.) durchgeführt. Edelweiss Air arbeitet eng mit der Muttergesellschaft Swiss und anderen Fluggesellschaften der Star Alliance zusammen und ist auch unter den Codes dieser Gesellschaften zu finden.
Die Flüge gehören in der Regel nicht zu den billigsten und sind für tschechische Reisende nicht gerade ein Schnäppchen.