Der kleinere Flughafen auf der Insel Mykonos liegt 4 km südöstlich des Stadtzentrums und etwa 10 km vom neuen Hafen von Mykonos entfernt, von wo aus man mit dem Boot zu den umliegenden Inseln wiebeispielsweise Tinos gelangen kann.

Der Flughafen wird hauptsächlich in den Sommermonaten genutzt, wenn er so stark ausgelastet ist, dass eine Beschränkung gilt, die die Verweildauer von Flugzeugen auf dem Vorfeld auf maximal 1 Stunde begrenzt.

Im Sommer wird der Großteil der Flüge zum Flughafen von easyJet, Wizz Air und Ryanair durchgeführt. Die Saison dauert hier von Juni bis Oktober; in dieser Zeit gibt es auch die meisten Direktverbindungen.

Regelmäßige ganzjährige Flüge gibt es nur nach Athen. Flüge in die griechische Hauptstadt, einschließlich Anschlussflüge weiter nach Europa, können Sie auf der Website der griechischen Fluggesellschaft buchen: aegenair.com oder skyexpress.gr.

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Das einzige Flughafenterminal ist sehr übersichtlich, und die Entfernung vom Eingang des Terminals zum Flugzeug beträgt weniger als 100 Meter. Während der Sommersaison sollten Sie sich auf einen Mangel an Sitzplätzen und Warteschlangen bei der Sicherheitskontrolle einstellen, die sich bis vor das Terminal erstrecken (diese können bis zu 30 Minuten dauern).