Iqaluit ist der größte Flughafen im kanadischen Territorium Nunavut und einer der wichtigsten Stützpunkte von Canadian North.

Iqaluit wird im Sommer auch von Air Greenland von Grönlands Hauptflughafen Nuuk GOH aus angeflogen.

Direktflüge gibt es vor allem zu Flughäfen im Nunavut-Territorium, in den Nordwest-Territorien sowie zu den großen Flughäfen im Süden Kanadas - Montreal und Ottawa.

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Aufgrund der extremen Wintertemperaturen ist der Flughafen Iqaluit häufig einer der Teststandorte für neue Airbus-Flugzeuge.